Es profesor del Instituto de Estudios Políticos y Relaciones Internacionales de la Universidad Francisco Marroquín, también es miembro del grupo Ideas e Instituciones. Lemus se graduó del Harvad College, con un BA in Government en el 2012, y  tiene un master en Business Administration por la UNIS Business School.  Jonatan ha escrito más de 70 publicaciones de opinión sobre temas políticos nacionales en República.gt, fue director del área de investigaciones para el desarrollo del CACIF, consultor de la Universidad Rafael Landívar, ASIES, así como para la Asociación de Investigaciones y Estudios sociales.